叙四诊初生门惊风门痫证门疳证门呕吐门泻证门感冒风寒门瘟疫门暑证门霍乱门痢疾门疟疾门咳嗽门喘证门痰证门疝证门淋证门头痛门腹痛门黄胆门水肿门腹胀门发热门癖疾门汗证门失血门杂证门幼科证治汇方
徐序自序凡例卷之一提纲门中风似中风伤风中寒暑症湿症燥症火症卷之二内因门气症血症痰症饮症伤食伤酒郁症脾胃劳倦虚损痨瘵虫病卷之三外体门发热恶寒汗病疟疾斑疹黄病水肿破伤风疠风痹症痛风麻木病卷之四上窍门眩晕头
序序刻孙真人眼科秘诀序卷之一孙真人眼科总理七十二症秘诀冲和汤玄灵圣方制炉甘石药开明汤十大将军冲翳散揭障丹十二将军二圣散论二圣散扫雾丹制蕤仁之法大决明散赛宝丹调合赛宝丹法补脑还精丸外治烂弦迎风有泪方卷之
自序卷一调经门经水先期而来经水过期而来经行腹痛血风卷二血崩便浊白淫淋证白带血癖经准不孕热入血室卷三广嗣论胎前门受妊脉法男女脉法双胎脉法死胎脉法鬼胎脉法逐月胎形论妊娠调护法小产安胎卷四妊娠中风妊娠伤寒妊
灵药秘方
《本草衍义》提要序卷一序例上衍义总叙卷二序例中卷三序例下内容卷四玉泉丹砂空青绿青云母石钟乳朴硝芒硝硝石英硝矾石滑石紫石英白石英赤石脂白石脂石中黄子婆娑石无名异菩萨石卷五金屑银屑水银水银粉雄黄雌黄石硫黄
原序卷之一一·条令二·检覆总说上三·检覆总说下四·疑难杂说上卷之二五·疑难杂说下六·初检七·覆检八·验尸九·妇人附·小儿尸并胞胎十·四时变动十一·洗罨十二·验未埋瘗尸首十三·验坟内及屋下攒殡尸十四·验
脉学阐微
濒湖炮炙法
第一册卒中暴厥中风中寒中暑中湿中气中食中恶伤暑伤湿伤燥伤饮食伤劳倦虚劳传尸劳发热潮热恶寒往来寒热外热内寒，外寒内热上热下寒，上寒下热疟厥第二册气郁痞水肿胀满积聚痰饮咳嗽喘短气第三册呕吐膈气呕吐反胃噎吐